廣州呼吸疾病研究所（簡稱呼研所）位于廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院（原廣州醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院）內(nèi)，創(chuàng)建于1979年，是國內(nèi)成立的呼吸疾病研究機構(gòu)之一，其前身是廣州市第四人民醫(yī)院慢性支氣管炎防治小組。

1983年，被批準(zhǔn)為碩士學(xué)位授予單位；

1993年，被評為廣東省重點學(xué)科；

1994年，被評為廣東省呼吸疾病研究重點實驗室；

1996年，被廣東省衛(wèi)生廳批準(zhǔn)為廣東省“五個一”科技攻關(guān)工程重點實驗室；同年，廣州市教育基金百萬行和廣州市教委撥款250萬建成廣州呼吸監(jiān)護中心；

1999年，被批準(zhǔn)為國家藥監(jiān)局臨床藥理研究基地，同年與北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部聯(lián)合培養(yǎng)博士后；

2000年，被批準(zhǔn)為醫(yī)學(xué)博士學(xué)位授予單位；

2002年，基礎(chǔ)實驗部搬遷至面積達3000平方米的海印實驗室；同年，霍英東先生捐資1000萬興建的英東廣州重癥監(jiān)護醫(yī)學(xué)中心落成；

2003年，呼吸科獲教育部重點學(xué)科，并在2006年復(fù)評中排名第一；

2004年，設(shè)立內(nèi)科學(xué)博士后工作流動站；

2005年，與中科院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院成立呼吸疾病聯(lián)合實驗室；

2006年，胸外科被衛(wèi)生部評為華南地區(qū)唯一的肺移植資質(zhì)基地；

2007年，獲科技部批準(zhǔn)，建設(shè)國內(nèi)唯一的呼吸疾病國家重點實驗室，并于2010年6月正式通過驗收，2011年3月首次通過科技部對重點實驗室的評估；

2008年，胸外科成為全國三大胸腔鏡培訓(xùn)基地之一；

2009年12月，《Journal of Thoracic Disease》（胸部疾病雜志）正式創(chuàng)刊；

2010年，呼吸疾病防治研究創(chuàng)新團隊獲廣東省首屆南粵功勛獎；呼研所被評為廣東省呼吸醫(yī)學(xué)工程技術(shù)開發(fā)中心；重癥醫(yī)學(xué)科被評為國家臨床重點?？疲恢忻?、中加聯(lián)合實驗室分別成立；

2011年，胸外科被評為國家臨床重點?？?；

2012年，被評為廣東省呼吸醫(yī)學(xué)工程實驗室；呼吸內(nèi)科被評為國家臨床重點?？?；

2013年，獲批成為我國首批13家國家臨床醫(yī)學(xué)研究中心之一。

呼研所現(xiàn)已成為國內(nèi)融呼吸疾病醫(yī)療、研究與教學(xué)為一體的單位。下設(shè)呼吸內(nèi)科、胸外科、重癥醫(yī)學(xué)科、變態(tài)反應(yīng)科等臨床學(xué)科和基礎(chǔ)實驗、臨床實驗兩個研究部門。其中，呼吸內(nèi)科、重癥醫(yī)學(xué)科、胸外科均為國家臨床重點?？?，共開放床位350多張。